一、按发起者性质划分
由生产商发起的连锁店。生产商采取纵向一体化策略，可以直接投资监理正规连锁组织以销售本企业的产品，也可以以产品销售权、产品品牌、商标等作为特许权，与零售商店建立特许连锁体系；还可以在生产商主持下由中小零售店联合成立自愿连锁组织。
由批发商发起的连锁店。批发商可以采取横向一体化策略，建立新的批发网点，也可以收购兼并其他批发商，从而形成批发连锁网络，也可以向其他批发商提供特许权，构建特许网络；批发商也可以采取纵向一体化策略，投资建立直营零售网点，或建立特许零售网点；最常见的是以批发商为核心或主导企业建立自愿连锁组织，批发商承担商品的采购、仓储、配送任务。
由零售商发起的连锁店。经营比较成功的零售商可以采取横向一体化策略投资建立直营店，或收购小的连锁店，或向其他零售商出卖特许权构建特许连锁网。
二、按经营地区划分
按连锁体系是否有国外支店分为国内连锁店和国际性连锁店。
按连锁体系在国内分布情况可分为区域性连锁店和全国性连锁店。区域性连锁店也称地区性、地方性连锁店，其总部及所有成员店都集中于同一城市或同一地区。成员点分布于全国不同地区，则称全国性连锁店，其产品多维知名品牌，标准化程度高，顾客需求差异小。
绝大多数成功的连锁体系是从地区性连锁店扩展为全国性连锁店，进而成为国际性连锁店的。也有些连锁体系是从地区性连锁店直接发展为国际性连锁店的。绝大多数的国际性连锁店是直营连锁和特许连锁。
三、按行业和店铺形态分
按行业和店铺形态也可以对连锁经营进行分类，包括连锁百货商店、连锁超级市场、连锁折扣店、连锁仓储俱乐部、连锁专营店、连锁美容美发店、连锁培训学校、连锁药店、连锁医院等。
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