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2022年8月4日，中国医学科学院发布2021年度中国医院/中国医学院校科技量值（STEM）。深圳市第三人民医院医院（南方科技大学第二附属医院）在五年ASTEM（学科）排名中，传染病学和结核病学双双位列全国第4位，均为广东省内第1位，呼吸病学位列第28位，深圳市内第1位、广东省内第4位。在医院五年ASTEM（综合）排名中位列全国第80位（广东省内第10位），是深圳唯一进入前100名的单位。
医院五年ASTEM综合榜
医院2021年度STEM综合榜
医院五年ASTEM学科榜-结核病学
医院五年ASTEM学科榜-传染病学
医院五年ASTEM学科榜-呼吸病学
2021年度,深圳市三医院STEM（综合）排名全国第76位，为广东省第10位，深圳市第1位。在此次发布的29个STEM（学科）全国排名中，深圳市三医院结核病学排名全国第5名（广东省内第1位），传染病学排名全国第7名（广东省内第1位），在结核病和传染病领域的科研能级稳步提升。此外，深圳市三医院呼吸病学排名第24位，消化病学排名第46位，护理学排名第60位，科研实力较2020年度明显增强。
科技量值评价体系着眼于在我国新发展阶段对医学机构提升发展质量的导引作用，着重体现科技创新水平与学科发展方向，促进医学机构高质量发展。通过科技量值研究，为医院科技管理工作提供新的手段和工具，形成激励医学科技创新的正确导向，推动医院学科建设，提高医学科技发展水平，提升医院的医疗服务能级。
深圳国家感染性疾病临床医学研究中心主任、深圳市三医院党委书记刘磊表示，“十四五”开局，医院开启了以高质量发展为主题的新发展阶段，深圳国家感染性疾病临床医学研究中心的学科引领效应、网络辐射效应、人才聚集效应日益彰显，医院科技平台设施日臻完善，研究投入不断增大，研究氛围日趋浓厚，重大研究成果不断涌现。
深圳市三医院院长卢洪洲表示，未来，医院将锚定“亚洲一流、世界领先”的目标，以国家感染性疾病临床医学研究中心为核心，感染病国家临床重点专科与器官移植学科建设为“两翼”，新发突发传染病、结核病、肝病、艾滋病为“四梁”，努力实现多个品牌学科全面突破，为实现医院高质量发展和支撑本市生物医药产业创新发展提供坚实保障。
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